Fermentlər (fermentlər) yüksək katalitik fəaliyyət və spesifikliyə malik olan unikal bir protein növüdür. Zülalların, yağların, şəkərlərin və həyat proseslərində bir çox mürəkkəb kimyəvi reaksiyaların sintezi və deqradasiyası hamısı fermentlərlə sıx bağlıdır. Təxminən 700 növ ferment aşkar edilmişdir ki, bu da onların funksiyalarına əsasən altı kateqoriyaya təsnif edilə bilən, hidrolazlar, oksidoreductases, lyazes, lyazes, ligazalar və ya sintetazlar. Bədəndəki bəzi fermentlər fərqli quruluş və ölçülərə malikdir, eyni katalitik funksiyanı bölüşür və bu fermentlər isozimes adlanır. Məsələn, izocitrate dehidrogenase, malat dehidrogenase və randa hamısını isozymeslərə aiddir. Protein olmayan üzvi molekullar və ya ferment quruluşuna bağlayan metallar kollektiv olaraq kollektiv olaraq bir co-ferment adlandırılır. Bəzi fermentlər, amilaza və pepsin kimi klinik müalicələrdə istifadə edilmişdir ki, bu da qan laxtası və absesi həll edə biləcək streptokinaza, parazitləri və iltihab əleyhinə dərmanları öldürə biləcək Ficin Protease. 

Fermentlərin xüsusiyyətləri və identifikasiya reaksiyaları zülallarla eynidir. 

Peptidlər protein hidrolizinin ara məhsullarıdır. Ümumiyyətlə, onlar xətti və ya tsiklik bir quruluşu olan 2 ilə 20 amin turşularından ibarət olan maddələrə aiddir. Polipeptidlər və zülallar arasında dəqiq bir sərhəd yoxdur. Bir çox polipeptidin bioloji fəaliyyətə malikdir. Məsələn, sulu peptidlər qan tökə bilər, qurbağa dəri peptidləri qan damarlarını böyütə bilər və dəniz hare inhibitor maddələri şişlərlə mübarizə edə bilər. Bəzi bitki polipeptidləri tsiklik peptidlər, məsələn zəhərli tsepli peptidlər kimi tsiklik peptidlərdir. Fenolik birləşmələri olan bəzi peptidlər qan təzyiqini azalda bilər. Ağ çiçək biyaninin və Ginseng-də anti-lipid parçalanma peptidlərinin gövdələrində oksiotokin peptidləri də var. 

Protein molekulları və polipeptidlər arasındakı əsas fərq zülalların daha mürəkkəb məkan düzənliyində yerləşir. Polipeptidlər peptid istiqrazları ilə əlaqəli α-amin turşusu birləşmələridir və eyni zamanda protein hidrolizinin aralıq məhsullarıdır. İki amin turşusu molekullarının susuzlaşdırma daralması ilə yaranan birləşmələr dipeptidlər adlanır və eyni zamanda üç və ya daha çox amin turşusu molekullarının susuzlaşdırma kondensasiyası tərəfindən meydana gələn tetikeptsizlər və s. Birləşmələr də polipeptidlər adlandırıla bilər. Polipeptidlər qabaqcıl üzvi kimya əsasında aydın bir tərif var. Zülallar insan orqanizmindəki bütün hüceyrələrin və toxumaların vacib bir hissəsidir. Zülallar bədənin bütün vacib komponentlərində iştirak etməlidirlər. Ümumiyyətlə, bütün bədən keyfiyyətlərinin təxminən 18% -i üçün zülallar hesabı və ən vacib şey, həyat hadisələri ilə əlaqəli olmasıdır. Zülallar, qıvrıla-qıvrıla və qatlama yolu ilə amin turşularının polipeptid zəncirləri tərəfindən formalaşır və müəyyən bir məkan düzeni ilə qurulur. Bundan əlavə, protein asanlıqla udulmayan və həzm zamanı amin turşularına və ya kiçik peptidlərə və ya həzm zamanı kiçik peptidlərdə parçalanmaması lazım olan yüksək olmayan bir makromolekuldur. Kiçik peptidlər tirajla toxunulmamış olduqda, tullantı məhsulları və ya metabolitlər yoxdur və bədən tərəfindən tam istifadə edilə bilər. 

Protein məzmunu yüksəkdir, ümumiyyətlə 10.000-dən yuxarıdır. Molekulyar çəki nə qədər böyükdürsə, o qədər də səthi antigenik müəyyənləşdirənlər var, kimyəvi quruluş daha sabitdir və bədən tərəfindən məhv olmaq və ya məhv olmaq ehtimalı azdır. Uzun müddət bədəndə qalırlar, antikorlar istehsal edən və bədənin immun reaksiyasını stimullaşdıran hüceyrələrlə təmasda olmaq üçün kifayət qədər fürsət verirlər. Kiçik molekul peptidləri aşağı antigenicity və ya heç bir antigenicity yoxdur.