Dizayn sxemi və polipeptid peptid zəncirinin həlli

I. Xülasə
Peptidlər xüsusi makromolekullardır ki, onların ardıcıllığı onların kimyəvi və fiziki xüsusiyyətlərində qeyri-adi olur. Bəzi peptidlər sintez etmək çətindir, digərləri isə sintez etmək üçün nisbətən asandır, lakin təmizləmək çətindir. Praktik problem, sulu həll yollarında ən çox peptidlərin bir qədər həll olunmasıdır, buna görə hidrofob peptidin müvafiq hissəsi sulu həlledicilərin müvafiq hissəsi həll olunmalıdır, buna görə də bu həlledicilərin və ya tamponların öz məqsədləri üçün peptiddən istifadə etmək qadağan olunmasının, buna görə də bir neçə tərəfi tədqiqatçılar üçün peptidlərin dizaynı.

Dizayn sxemi və polipeptid peptid zəncirinin həlli
İkincisi, sintetik çətin peptidlərin düzgün seçimi
1. Aşağı tənzimlənən ardıcıllıqların ümumi uzunluğu
15-dən az qalıqdan peptidlər almaq daha asandır, çünki peptidin ölçüsü artır və xam məhsulun saflığı azalır. Peptid zəncirinin ümumi uzunluğu 20 qalıqdan kənarda artdıqca, dəqiq məhsul miqdarı əsas narahatlıqdır. Bir çox təcrübədə, 20-dən aşağı qalıq nömrəsini azaltmaqla gözlənilməz təsirləri əldə etmək asandır.
2. hidrofobik qalıqların sayını azaldın
Hidrofobik qalıqların böyük bir üstünlük təşkil etməsi, xüsusən bölgədəki 7-12 C-terminaldan olan qalıqlar, ümumiyyətlə sintetik çətinliklərə səbəb olur. Bu, qeyri-kafi birləşmə olaraq görülür, çünki bir b-qat vərəqi sintezdə əldə edilir. "Belə hallarda, ikidən çox müsbət və mənfi qalıqları çevirmək və ya peptid kompozisiyasını açmaq üçün peptidə gly və ya pro peptidinə qoymaq faydalı ola bilər."
3. "Çətin" qalıqlarının azaldılması
"Bir sıra CYS var, görüşdü, arg və ümumiyyətlə asanlıqla sintez olunmayan qalıqları sınayın." SER, ümumiyyətlə CYS-ə qeyri-istifadəçi alternativ olaraq istifadə ediləcəkdir.
Dizayn sxemi və polipeptid peptid zəncirinin həlli

Üçüncüsü, suda həll olunan düzgün seçim seçimini yaxşılaşdırın
1. N və ya C terminini tənzimləyin
Turşu peptidlərinə nisbətən (yəni pH 7-də mənfi yüklənmişdir), asetilasyon (n-terminus asetylation, c pulsuz bir carboxyl qrupu qorunur), mənfi yükü artırmaq tövsiyə olunur. Bununla birlikdə, əsas peptidlər üçün (yəni pH 7-də müsbət yüklənir), aminasiya (N-Terminusdakı N-Terminusdakı funkminalda pulsuz Amino qrupu) xüsusilə müsbət yükü artırmaq tövsiyə olunur.

2. Ardıcıllığı çox qısaldırın və ya uzat

Bəzi ardıcıllıqlar, TRP, Phe, Val, Val, Ile, Leu, Tyro və Ala və s. Kimi çox sayda hidrofobik amin turşuları, Tyrofobik qalıqları 50% -dən çox olduqda, bunları həll etmək asan deyil. Peptidin müsbət və mənfi dirəklərini daha da artırmaq üçün ardıcıllığı uzatmaq faydalı ola bilər. İkinci seçim, hidrofobik qalıqları biçərək müsbət və mənfi dirəkləri artırmaq üçün peptid zəncirinin ölçüsünü azaltmaqdır. Peptid zəncirinin müsbət və mənfi tərəflərinin daha güclü olması, su ilə reaksiya vermək ehtimalı daha yüksəkdir.
3. Suda həll olunan bir qalıq qoyun
Bəzi peptid zəncirləri üçün bəzi müsbət və mənfi amin turşularının birləşməsi su həllini yaxşılaşdıra bilər. Şirkətimiz, N-terminus və ya turşu peptidlərinin C-terminusunu glu-glu ilə birləşdirilmək tövsiyə edir. Əsas peptidin N və ya C terminası verildi və sonra LYS-LYS verildi. Ödənişli qrup yerləşdirilə bilmirsə, Ser-gly-ser da N və ya C terminində yerləşdirilə bilər. Bununla birlikdə, bu yanaşma peptid zəncirinin tərəfləri dəyişdirilə bilmədikdə işləmir.