Səthdə, dipeptidlər verən peptid bağlarının əmələ gəlməsi sadə bir kimyəvi bir prosesdir. Bu o deməkdir ki, iki amin turşusu komponentləri bir peptid istiqrazı, bir amide bond, susuzlaşarkən birləşdirilmişdir.
Peptid istiqrazının yaradılması, yüngül reaksiya şəraitində bir amin turşusunun aktivləşdirilməsidir. (A) Carboxyl Moity, İkinci Amin turşusu (b) Nukleofilik Aktivləşdirilmiş Carboxyl Moiety, sonra dipeptid (A-B) təşkil edir. "Əgər karboksil komponenti (a) qorunmursa, peptid bağının əmələ gəlməsi nəzarət edilə bilməz." Xətti və tsiklik peptidlər kimi məhsullar A-B hədəf birləşmələri ilə qarışdırıla bilər. Buna görə peptid istiqrazının formalaşmasına cəlb olunmayan bütün funksional qruplar peptid sintezi zamanı müvəqqəti geri çevrilə bilən bir şəkildə qorunmalıdır.
Beləliklə, peptid sintezi - hər bir peptid istiqrazının əmələ gəlməsi - üç addımlıq aqreqatlaşdırılmasını əhatə edir.
İlk addım, qoruma ehtiyacı olan bəzi amin turşularını hazırlamaq və amin turşularının zwittertionik quruluşu artıq mövcud deyil.
İkinci addım, n-qorunan amin turşusunun karboksil qrupunun aktiv aralıqa aktivləşdirildiyi və sonra peptid istiqrazının formalaşdığı peptid istiqrazları yaratmaq üçün iki addımlı bir reaksiyadir. Bu birləşdirilmiş reaksiya ya bir addımlı reaksiya, ya da iki ardıcıl reaksiya kimi baş verə bilər.
Üçüncü addım, qoruyucu bazanın seçmə çıxarılması və ya tam çıxarılmasıdır. Bütün çıxarılması yalnız bütün peptid zəncirləri toplanmasından sonra baş verə bilər, peptid sintezini davam etdirmək üçün qoruyucu qrupların seçmə çıxarılması da tələb olunur.
Çünki 10 amin turşuları (ser, tir, tir, asp, glu, lys, onun, sek və cys), seçmə qorunması tələb edən yan zəncirləmə funksional qrupları, peptid sintezi daha mürəkkəb hala gətirən yan zəncirləmə funksional qrupları ehtiva edir. Müvəqqəti və yarı daimi qorunma bazaları seçicilik üçün fərqli tələblərə görə fərqlənməlidir. Müvəqqəti qoruma qrupları amin turşusu və ya karboksil funksional qruplarının müvəqqəti qorunmasını əks etdirmək üçün növbəti addımda istifadə olunur. Yarım Daimi Qoruyucu Qruplar, artıq qurulmuş peptid istiqrazları və ya amin turşusu yan zəncirlərinə, bəzən sintez zamanı müdaxilə etmədən çıxarılır.
"İdeal olaraq, karboksil komponentinin aktivləşdirilməsi və peptid istiqrazlarının (bağlama reaksiyalarının) sonrakı formalaşması sürətli, racemik və ya məhsul meydana gəlmədən sürətli olmalıdır və yüksək məhsuldarlıq əldə etmək üçün molar reaktivləri tətbiq edilməlidir." Təəssüf ki, kimyəvi birləşmə metodlarından heç biri bu tələblərə cavab vermir və az sayda praktik sintez üçün uyğundur.
Peptid sintezi zamanı müxtəlif reaksiyalara cəlb olunan funksional qruplar ümumiyyətlə əl mərkəzi, glisin yeganə istisnası ilə əlaqəlidir və potensial fırlanma riski var.
Peptid sintez dövründəki son addım bütün qoruyucu qrupların çıxarılmasıdır. Qoruyucu qrupların seçmə çıxarılması, dipeptid sintezində qorunmanın tam çıxarılması tələbinə əlavə olaraq peptid zəncirinin uzadılması üçün vacibdir. Sintetik strategiyalar diqqətlə planlaşdırılmalıdır. Strateji seçimdən asılı olaraq, n α-amin və ya karboksil qoruyucu qrupları seçərək silmək olar. "Strategiya" termini fərdi amin turşularının kondensasiya reaksiyalarının ardıcıllığına aiddir. Ümumiyyətlə, tədricən sintez və fraqment kondensasiya arasında fərq var. Peptid sintezi ("şərti sintez" kimi də tanınır) həllində baş verir. Əksər hallarda, peptid zəncirinin tədricən uzanması yalnız daha qısa fraqmentləri sintez etmək üçün peptid zəncirindən istifadə edərək sintez edilə bilər. Daha uzun peptidləri sintez etmək üçün hədəf molekullar müvafiq fraqmentlərə bölünməlidir və C terminində fərqlənmə dərəcəsini minimuma endirə biləcəklərini müəyyənləşdirməlidir. Fərdi fraqmentlər tədricən toplaşdıqdan sonra hədəf birləşmə də qoşulacaqdır. Peptid sintezinin strategiyası ən yaxşı və ən uyğun qoruyucu fraqmentin seçilməsini və peptid sintezinin strategiyası, qoruyucu bazaların ən uyğun birləşməsinin və fraqment birləşmənin ən uyğun birləşməsinin seçilməsini əhatə edir.
Saat: 2025-07-02