Transmembrane peptidlərinin çox növləri var və onların təsnifatı fiziki və kimyəvi xüsusiyyətlərə, mənbələrə, qəbuletmə mexanizmlərinə və biotibbi tətbiqlərə əsaslanır. Fiziki və kimyəvi xüsusiyyətlərinə görə, membran nüfuz edən peptidlər üç növə bölmək olar: kationik, amphiphilic və hidrofobik. Cation və amphiphilic membran nüfuz edən peptidlər 85%, hidrofobik membran nüfuz edən peptidlər yalnız 15% təşkil edir.
1. kationik membran nüfuz edən peptid
Cationic Transmembrane Peptidləri, Tat, Penetratin, Polyanarjinin, P22N, DPV3 və DPV6 kimi Arginin, lizin və histidin olan qısa peptidlərdən ibarət olan qısa peptidlərdən ibarətdir. Bunların arasında Argininin, hüceyrə membranında mənfi yüklənmiş fosfor turşusu qrupları və fizioloji pH dəyəri olan membrana mediate ötürmə peptidləri ilə hidrogen bağı olan guanidine olan Guanidine var. Oligarjinin (3 R-dən 12 R-ə qədər) tədqiqatları, membran nüfuz etmə qabiliyyəti yalnız argininin miqdarı 8-nin miqdarı olduqda, membran nüfuz qabiliyyəti argininin miqdarının artması ilə getdikcə əldə olunduğunu göstərdi. Lizin, arginin kimi kationik olsa da, guanidine ehtiva etmir, buna görə də tək olduqda, membran nüfuz effektivliyi çox yüksək deyil. Futaki et al. (2001) tapıldı ki, yaxşı membran nüfuz effekti yalnız peptid peptid nüfuz edən peptidin nüfuz edən peptidin ən az 8 müsbət bir amin turşusu olduqda əldə edilə bilər. Müsbət ittiham olunan amin turşusu qalıqları, membrana nüfuz edən pepretidlərin, digər amin turşularının eyni dərəcədə vacib olduğunu, məsələn, F, penetratinin penetratinin nüfuzlu olması kimi eyni dərəcədə vacibdir.
Kationik transmembrane peptidlərinin xüsusi sinfi, arginin, lizin və prolin ilə zəngin qısa peptidlərdən ibarət olan nüvə lokalizasiyası ardıcıllığıdır və nüvə məsaməsi kompleksi vasitəsilə nüvəyə nüvə aparıla bilər. NLSS, müvafiq olaraq əsas amin turşularının bir və iki qrupundan ibarət olan tək və ikiqat yazmağa bölmək olar. Məsələn, Simian virusundan PKKKRKV 40 (SV40) tək bir yazma NLS, nüvə protein isə ikiqat yazma NLS-dir. Krpaatkkaqqakkk, membran transmembranasında rol oynaya biləcək qısa ardıcıllıqdır. Çünki NLSS-in əksəriyyəti 8-dən az olan NLSS-dən az olan NLSS effektiv transmembrane peptidləri deyil, lakin Amphilichilic Transmembrane peptidlərini yaratmaq üçün hidrofob peptid ardıcıllığı ilə əlaqəli olduqda effektiv transmembrane peptidləri ola bilər.
2. Amphiphilic transmembrane peptidi
Amphiphilic transmembrane peptidləri, ilkin amphilik, ikincil α-dakiyal amphiphilic, β qatlanan amphilic və prolin-zənginləşdirilmiş amphiliic-in ilkin amphilik, β qatlanan amphilic və prolin-zənginləşdirilmiş amphilic-ə bölünmüş hidrofilik və hidrofobik domenlərdən ibarətdir.
İbtidai tipli amphiphilic offhiphilic ton peprran peptidləri, mpg (glaflgflglglgaagstmgawagsqpkkkkkkv) və peps kimi hidrofob peptid ardıcıllığı ilə, hər ikisi də sv40 nüvə lokalizatoru siqnalına əsaslanır MPG Hydrofobik domeni HİV Glikoprotein 41 (Galflgglgaagstmg A), Pep-1-in hidrofobik sahəsi yüksək membran yaxınlığı (Ketwn WwTew) olan triptofan zəngin bir qrupu ilə əlaqəlidir. Bununla birlikdə, hər ikisinin hidrofobik domenləri WSQP vasitəsilə nüvə lokalizasiya siqnalı PKKKRKV ilə bağlıdır. Birincil amphiphilic transmimbrane peptidlərinin başqa bir sinfi, PVEC, ARF (1-22) və BPRPR (1-28) kimi təbii zülallardan təcrid olunmuşdur.
Orta α-Helical Amphiphilic Transmembrane peptidləri membrana α-heliklər vasitəsilə bağlayır və hidrofilik və hidrofobik amin turşusu qalıqları xəritə (klalklalkalalkla) kimi hirəvi quruluşun müxtəlif səthlərində yerləşir. Beta peptid tipli membran üçün membran, beta örtülmüş bir təbəqə yaratmaq bacarığı, membranın tipindən istifadə edərək, membranın nüfuz qabiliyyətini araşdırmaq müddətində membranının nüfuz etmə qabiliyyətinə çox vacibdir Parça, membranın nüfuz qabiliyyəti çox zəifdir. Proline zənginləşdirilmiş amphilichilic transmimbrane peptidlərində poliprinrate II (PPII) polipeptid quruluşunda polipeptid quruluşunda yüksək suda təmiz suda asanlıqla meydana gəlir. PPII, hər növbədə 3.6 amin turşusu qalıqları olan standart sağ əlli altlıq quruluşundan fərqli olaraq, növbə üçün 3.0 amin turşusu qalıqları olan sol əlli bir helixdir. PROLINE-zənginləşdirilmiş amphiphilic ötürmə peptidləri, bovine antimikrobiyal peptid 7 (BAC7), sintetik polipeptid (ppr) n (n 3, 4, 5 və 6 ola bilər) və s.
3. Hidrofobik membran peptid nüfuz edir
Hydrofobik transmembrane peptidləri, yalnız qütb olmayan amin turşusu qalıqları, amin turşusu ardıcıllığının ümumi ittihamının 20% -dən az, və ya transmembran üçün vacib olan hidrofobik moieties və ya kimyəvi qruplardan ibarətdir. Bu mobil transmembrane peptidləri çox vaxt gözdən qaçırsa da, onlar, Fibroblast böyümə faktoru (K-FGF) və Fibroblast böyümə faktoru, Kaposinin Sarcoma-dan (F-GF12) kimi mövcuddur.
Time: 2025-07-01